안전을 위하여 user agent checking 과 conditional comment를 둘다 쓰는 방법입니다.

<?php if (preg_match('/\bmsie 6/i', $_SERVER['HTTP_USER_AGENT'])) { ?>
  <!--[if IE 6]>
      이 사이트는 IE6를 지원하지 않습니다. 쓰지마세요. 
  <![endif]-->
<?php } ?>

• 출처: http://stackoverflow.com/questions/671890/can-i-detect-ie6-with-php